- Language: Español English

Índice de servicios

Modelado de estructuras proteicas

Descripción:

Modelado de proteínas de estructura desconocida a partir de su secuencia, usando algoritmos estándar y otros desarrollados por nuestro grupo. El precio puede variar dependiendo del número de dominios a predecir y la similitud de la secuencia con la proteína molde, una semejanza remota requiere métodos más complejos y consumen más recursos.

Precio interno: 60 €
Precio externo: 120 €
Precio externo no académico: 180 €
Solicita el servicio

Modelado de cambios de conformación de una proteína de estructura conocida

Descripción:

Modelamos cambios de conformación usando modos normales de amplitud, obtenidos usando un modelo de red elástico (ENM desarrollado por nosotros) que utiliza los ángulos de torsión como grados de libertad y que puede ser resuelto de forma analítica en un corto espacio de tiempo computacional.

Precio interno: 30 €
Precio externo: 60 €
Precio externo no académico: 90 €
Solicita el servicio

Dinámicas moleculares de las proteínas

Descripción:

Somos capaces de simular la dinámica de una proteína a través de dinámicas moleculares utilizando campos de fuerza realistas. En este sentido también podemos predecir la interacción de energías en un complejo proteico.

Precio interno: 100 € * (TiempoSimulacion (ns)/5 + Longitud_Proteina (AA)/100)
Precio externo: 150 € * (TiempoSimulacion (ns)/5 + Longitud_Proteina (AA)/100)
Precio externo no académico: 200 € * (TiempoSimulacion (ns)/5 + Longitud_Proteina (AA)/100)
Solicita el servicio

Predicción de la estabilidad del plegamiento proteico

Descripción:

Dada una secuencia proteica con estructura conocida (o predecible de forma fiable), podemos predecir su estabilidad respecto a su tendencia a estar en una conformación desplegada o a adoptar plegamientos incorrectos, usando nuestro propio algoritmo. Además somos capaces de predecir su tendencia a estar desplegada de forma nativa gracias al algoritmo 'disopred2' (de David Jones), y al agregamiento en base al algoritmo TANGO desarrollado por Luis Serrano.

Precio interno: 30 €
Precio externo: 60 €
Precio externo no académico: 90 €
Solicita el servicio

Generación de alineamientos múltiples y dendogramas

Descripción:

Somos capaces de generar múltiples alineamientos y dendrogramas tanto de una secuencia de una proteína como de su estructura. Para las secuencias usaríamos el algoritmo MUSCLE u otros basados en 'Hidden Markov Models'. En el caso de las estructuras usaríamos el algoritmo MAMMOTHmult desarrollado en nuestro laboratorio. A partir de este alineamiento somos capaces de construir un árbol representando las relaciones evolutivas entre las proteínas. Las secuencias proteicas pueden ser proporcionadas por el usuario o bien ser generadas por una búsqueda BLAST o PSI-BLAST (coste adicional de 10€).

Precio interno:
Alineamiento de secuencia : 15€ hasta 500 proteinas, consultar precio por un mayor número.
Alineamiento de estructura: 15€ hasta 20 proteinas, consultar precio por un mayor número.
Precio externo:
Alineamiento de secuencia : 30€ hasta 500 proteinas, consultar precio por un mayor número.
Alineamiento de estructura: 40€ hasta 20 proteinas, consultar precio por un mayor número.
Precio externo no académico:
Alineamiento de secuencia : 45€ hasta 500 proteinas, consultar precio por un mayor número.
Alineamiento de estructura: 60€ hasta 20 proteinas, consultar precio por un mayor número.
Solicita el servicio

Otros problemas en biología computacional

Descripción:

Estamos abiertos a cualquier tipo de consulta relacionada con la biología computacional.

Precio interno: Consulta gratuita, analisis 10 €/h.
Precio externo: 20€/h y 1 €/CPU h.
Precio externo no académico: 40€/h y 2 €/CPU h.
Solicita el servicio

Web design: Alfonso Núñez Salgado